MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 35176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013156	AGA	2	6	231709	231714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810207
5502	NC_013156	TTC	2	6	231839	231844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810207
5503	NC_013156	TGT	2	6	232021	232026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810207
5504	NC_013156	TGA	2	6	232027	232032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
5505	NC_013156	GGA	2	6	232043	232048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810207
5506	NC_013156	TAG	2	6	232113	232118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810207
5507	NC_013156	ATC	2	6	232214	232219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810207
5508	NC_013156	AGCTA	2	10	232262	232271	40 %	20 %	20 %	20 %	256810207
5509	NC_013156	TAA	2	6	232551	232556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810208
5510	NC_013156	CTG	2	6	232564	232569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810208
5511	NC_013156	GCT	2	6	232589	232594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810208
5512	NC_013156	GTC	2	6	232640	232645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810208
5513	NC_013156	GAAA	2	8	232731	232738	75 %	0 %	25 %	0 %	256810208
5514	NC_013156	GAG	2	6	232775	232780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810208
5515	NC_013156	ATT	2	6	232801	232806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810208
5516	NC_013156	CGG	2	6	232822	232827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256810208
5517	NC_013156	GCT	2	6	232856	232861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810208
5518	NC_013156	CCG	2	6	232881	232886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256810208
5519	NC_013156	AATGA	2	10	232889	232898	60 %	20 %	20 %	0 %	256810208
5520	NC_013156	GAT	2	6	233086	233091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810209
5521	NC_013156	ATGTTC	2	12	233098	233109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	256810209
5522	NC_013156	TTA	2	6	233126	233131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810209
5523	NC_013156	AAT	2	6	233188	233193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810209
5524	NC_013156	AGG	2	6	233242	233247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810209
5525	NC_013156	TGC	2	6	233326	233331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810209
5526	NC_013156	GGA	2	6	233336	233341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810209
5527	NC_013156	AGA	2	6	233371	233376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810209
5528	NC_013156	GAA	2	6	233435	233440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810209
5529	NC_013156	TCC	2	6	233443	233448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810209
5530	NC_013156	AGA	2	6	233452	233457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810209
5531	NC_013156	TCC	2	6	233512	233517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810209
5532	NC_013156	TTG	2	6	233544	233549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810209
5533	NC_013156	ATT	2	6	233551	233556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810209
5534	NC_013156	CAA	2	6	233580	233585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810209
5535	NC_013156	TGA	2	6	233596	233601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810209
5536	NC_013156	A	7	7	233611	233617	100 %	0 %	0 %	0 %	256810209
5537	NC_013156	TGTT	2	8	233678	233685	0 %	75 %	25 %	0 %	256810209
5538	NC_013156	AGAC	2	8	233781	233788	50 %	0 %	25 %	25 %	256810209
5539	NC_013156	GCT	2	6	233843	233848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810209
5540	NC_013156	ATT	2	6	233872	233877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810209
5541	NC_013156	CTG	2	6	233895	233900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810209
5542	NC_013156	TAAT	2	8	233904	233911	50 %	50 %	0 %	0 %	256810209
5543	NC_013156	GGTAA	2	10	233996	234005	40 %	20 %	40 %	0 %	256810210
5544	NC_013156	TGT	2	6	234082	234087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810210
5545	NC_013156	CTG	2	6	234096	234101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810210
5546	NC_013156	CAC	2	6	234152	234157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810210
5547	NC_013156	TGC	2	6	234181	234186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810210
5548	NC_013156	A	7	7	234214	234220	100 %	0 %	0 %	0 %	256810210
5549	NC_013156	GA	3	6	234223	234228	50 %	0 %	50 %	0 %	256810210
5550	NC_013156	ACTTCT	2	12	234270	234281	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	256810210
5551	NC_013156	GCA	2	6	234284	234289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810210
5552	NC_013156	AGA	2	6	234402	234407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810210
5553	NC_013156	TTG	2	6	234408	234413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810210
5554	NC_013156	GGA	2	6	234422	234427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810210
5555	NC_013156	GGCA	2	8	234462	234469	25 %	0 %	50 %	25 %	256810210
5556	NC_013156	AGA	3	9	234481	234489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810210
5557	NC_013156	GAT	2	6	234520	234525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810210
5558	NC_013156	TAA	2	6	234552	234557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810210
5559	NC_013156	GAAAA	2	10	234687	234696	80 %	0 %	20 %	0 %	256810210
5560	NC_013156	CTG	2	6	234711	234716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810210
5561	NC_013156	A	6	6	234779	234784	100 %	0 %	0 %	0 %	256810210
5562	NC_013156	AATC	2	8	234911	234918	50 %	25 %	0 %	25 %	256810210
5563	NC_013156	ACC	2	6	234927	234932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810210
5564	NC_013156	AGTT	2	8	234948	234955	25 %	50 %	25 %	0 %	256810210
5565	NC_013156	ATT	2	6	234979	234984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810210
5566	NC_013156	AGT	2	6	235054	235059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810210
5567	NC_013156	TTG	2	6	235113	235118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810210
5568	NC_013156	CAA	2	6	235158	235163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810210
5569	NC_013156	CAA	2	6	235178	235183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810210
5570	NC_013156	GCT	2	6	235184	235189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810210
5571	NC_013156	TAAA	2	8	235201	235208	75 %	25 %	0 %	0 %	256810210
5572	NC_013156	TGA	2	6	235589	235594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810211
5573	NC_013156	ATG	2	6	235610	235615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810211
5574	NC_013156	ATAGAC	2	12	235663	235674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256810211
5575	NC_013156	ATGC	2	8	235695	235702	25 %	25 %	25 %	25 %	256810211
5576	NC_013156	AGG	2	6	235739	235744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810211
5577	NC_013156	AAG	2	6	235843	235848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810211
5578	NC_013156	TGA	3	9	235851	235859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810211
5579	NC_013156	ATC	2	6	235942	235947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810211
5580	NC_013156	AAG	2	6	235956	235961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810211
5581	NC_013156	GTTG	2	8	236008	236015	0 %	50 %	50 %	0 %	256810211
5582	NC_013156	GTA	2	6	236102	236107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810211
5583	NC_013156	CTAT	2	8	236135	236142	25 %	50 %	0 %	25 %	256810211
5584	NC_013156	GAA	2	6	236150	236155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810211
5585	NC_013156	AAG	2	6	236161	236166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810211
5586	NC_013156	AGG	2	6	236167	236172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810211
5587	NC_013156	TATT	2	8	236211	236218	25 %	75 %	0 %	0 %	256810211
5588	NC_013156	TCC	2	6	236286	236291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810211
5589	NC_013156	TG	4	8	236315	236322	0 %	50 %	50 %	0 %	256810211
5590	NC_013156	GTTAA	2	10	236356	236365	40 %	40 %	20 %	0 %	256810211
5591	NC_013156	CAC	2	6	236369	236374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810211
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5593	NC_013156	GAA	2	6	236427	236432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810211
5594	NC_013156	GAT	2	6	236470	236475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810211
5595	NC_013156	GAA	2	6	236478	236483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810211
5596	NC_013156	GT	3	6	236625	236630	0 %	50 %	50 %	0 %	256810211
5597	NC_013156	CCT	2	6	236706	236711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810211
5598	NC_013156	GA	3	6	236732	236737	50 %	0 %	50 %	0 %	256810211
5599	NC_013156	AAAG	2	8	236739	236746	75 %	0 %	25 %	0 %	256810211
5600	NC_013156	TTA	2	6	236797	236802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810212
5601	NC_013156	TGA	2	6	236837	236842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810212
5602	NC_013156	GA	4	8	236957	236964	50 %	0 %	50 %	0 %	256810212
5603	NC_013156	AAGA	2	8	236967	236974	75 %	0 %	25 %	0 %	256810212
5604	NC_013156	A	6	6	236982	236987	100 %	0 %	0 %	0 %	256810212
5605	NC_013156	ATT	2	6	237023	237028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810212
5606	NC_013156	CA	3	6	237082	237087	50 %	0 %	0 %	50 %	256810212
5607	NC_013156	ACA	2	6	237130	237135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810212
5608	NC_013156	CCCA	2	8	237262	237269	25 %	0 %	0 %	75 %	256810212
5609	NC_013156	ACA	2	6	237288	237293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810212
5610	NC_013156	TTC	2	6	237306	237311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810212
5611	NC_013156	AGA	2	6	237326	237331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810212
5612	NC_013156	TTG	2	6	237343	237348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810212
5613	NC_013156	AG	3	6	237357	237362	50 %	0 %	50 %	0 %	256810212
5614	NC_013156	CAG	2	6	237490	237495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810212
5615	NC_013156	AT	3	6	237501	237506	50 %	50 %	0 %	0 %	256810212
5616	NC_013156	TTC	2	6	237549	237554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810212
5617	NC_013156	AATGAC	2	12	237563	237574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	256810212
5618	NC_013156	AG	3	6	237790	237795	50 %	0 %	50 %	0 %	256810212
5619	NC_013156	ATG	2	6	237807	237812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810212
5620	NC_013156	CAA	2	6	237910	237915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810212
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5622	NC_013156	ATGG	2	8	237984	237991	25 %	25 %	50 %	0 %	256810212
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5742	NC_013156	ATT	2	6	244184	244189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810217
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5996	NC_013156	TTCC	2	8	253643	253650	0 %	50 %	0 %	50 %	256810225
5997	NC_013156	T	6	6	253653	253658	0 %	100 %	0 %	0 %	256810225
5998	NC_013156	CATTT	2	10	253720	253729	20 %	60 %	0 %	20 %	256810225
5999	NC_013156	CT	3	6	253740	253745	0 %	50 %	0 %	50 %	256810225
6000	NC_013156	TCA	2	6	253765	253770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810225

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